Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTF1AQ7RTS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTF1AQ7RTS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms