Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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