Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRSAM1Q6UWE0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms