Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASC1Q6TDU7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASC1Q6TDU7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms