Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRPL54Q6P161 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRPL54Q6P161 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms