Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms