Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INTS3Q68E01 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INTS3Q68E01 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms