Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCERG1LQ5VWI1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCERG1LQ5VWI1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms