Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF38BQ5VTL8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms