Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF3Q5SZQ8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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