Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HABP4Q5JVS0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms