Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF2Q5BJF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms