Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms