Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms