Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSR1Q2NL82 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSR1Q2NL82 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms