Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPP1Q16831 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms