Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP6Q16828 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP6Q16828 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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