Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN1Q16799 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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