Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LY6EQ16553 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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