Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK3Q16288 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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