Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN9AQ15858 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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