Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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TAF1AQ15573 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TAF1AQ15573 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TAF1AQ15573 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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TAF1AQ15573 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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