Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RBBP5Q15291 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms