Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
R3HDM1Q15032 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
R3HDM1Q15032 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
R3HDM1Q15032 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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