Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHPRHQ149N8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHPRHQ149N8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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