Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SQLEQ14534 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SQLEQ14534 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms