Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE4AQ14139 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
UBE4AQ14139 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE4AQ14139 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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