Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCNIQ14094 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCNIQ14094 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms