Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL9A3Q14050 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A3Q14050 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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