Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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