Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4BQ13620 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL4BQ13620 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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