Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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DNASE1L3Q13609 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DNASE1L3Q13609 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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