Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NAE1Q13564 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NAE1Q13564 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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NAE1Q13564 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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