Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LSAMPQ13449 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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