Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SCGB2A2Q13296 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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SCGB2A2Q13296 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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