Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RESTQ13127 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RESTQ13127 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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