Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRJQ12913 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRJQ12913 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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