Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 TRM3YDL112W 4311 nt1.42□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 SSK2YNR031C 4740 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 CAT2YML042W 2013 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 snR76snR76 109 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 HLR1YDR528W 1272 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 RNP1YLL046C 750 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YML084WYML084W 309 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 ECM13YBL043W 774 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 GCY1YOR120W 939 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 NAM7YMR080C 2916 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 YOR019WYOR019W 2193 nt1.41□□□□□ -2.18
RTR2Q12378 ARP5YNL059C 2268 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YGL138CYGL138C 1038 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YHL037CYHL037C 402 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YKL070WYKL070W 510 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YLR050CYLR050C 486 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 COA6YMR244C-A 315 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 LTO1YNL260C 597 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YOR146WYOR146W 306 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CTP1YBR291C 900 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 HKR1YDR420W 5409 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 BRR2YER172C 6492 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 UBP16YPL072W 1500 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 LYS9YNR050C 1341 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CLB5YPR120C 1308 nt1.4□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YFL015CYFL015C 495 nt1.39□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 PRM6YML047C 1059 nt1.39□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 RGM1YMR182C 636 nt1.39□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CFT1YDR301W 4074 nt1.39□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 VPH1YOR270C 2523 nt1.39□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SFB2YNL049C 2631 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CHC1YGL206C 4962 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 PUF4YGL014W 2667 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YGR114CYGR114C 390 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CSI1YMR025W 888 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YBR292CYBR292C 372 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 NUP192YJL039C 5052 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 APC5YOR249C 2058 nt1.38□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SOK2YMR016C 2358 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 GUK1YDR454C 564 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SAE2YGL175C 1038 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YJL147CYJL147C 1149 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SRP1YNL189W 1629 nt1.37□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 PIK1YNL267W 3201 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 RIT1YMR283C 1542 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 POL4YCR014C 1749 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 CPR5YDR304C 678 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YLR379WYLR379W 375 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SPC29YPL124W 762 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 TAZ1YPR140W 1146 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 ARL1YBR164C 552 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 TFC8YPL007C 1767 nt1.36□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 MFB1YDR219C 1398 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 DSS1YMR287C 2910 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 RBK1YCR036W 1002 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 GPI19YDR437W 423 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 MMF1YIL051C 438 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 YHC1YLR298C 696 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 MEI5YPL121C 669 nt1.35□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 ADR1YDR216W 3972 nt1.34□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 snR83snR83 306 nt1.34□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 TVP15YDR100W 432 nt1.34□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 SPO24YPR036W-A 204 nt1.34□□□□□ -2.19
RTR2Q12378 PBY1YBR094W 2262 nt1.34□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 TRL1YJL087C 2484 nt1.34□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 PLM2YDR501W 1566 nt1.34□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 SLY41YOR307C 1362 nt1.34□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 CTF4YPR135W 2784 nt1.33□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 NYV1YLR093C 762 nt1.33□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YNL234WYNL234W 1281 nt1.33□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 SRL1YOR247W 633 nt1.33□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 SXM1YDR395W 2835 nt1.33□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 MUM3YOR298W 1440 nt1.32□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 CDC31YOR257W 486 nt1.32□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 RPS10AYOR293W 318 nt1.32□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 SEC21YNL287W 2808 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 SYO1YDL063C 1863 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YGR190CYGR190C 366 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 REX3YLR107W 1215 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YMR181CYMR181C 465 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YOR203WYOR203W 354 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YBR277CYBR277C 402 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 AHC1YOR023C 1701 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 NUF2YOL069W 1356 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 RRP6YOR001W 2202 nt1.31□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 VPS16YPL045W 2397 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 RRG1YDR065W 1098 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 FMN1YDR236C 657 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 TCA17YEL048C 459 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 RGI2YIL057C 495 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 TPM2YIL138C 486 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YPR177CYPR177C 372 nt1.3□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 MON2YNL297C 4911 nt1.29□□□□□ -2.2
RTR2Q12378 YLR422WYLR422W 5799 nt1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.7 ms