Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBRQ0VD83 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms