Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP4Q09028 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms