Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms