Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSRP1Q08945 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSRP1Q08945 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms