Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DHX9Q08211 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms