Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP3CAQ08209 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms