Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR3Q06889 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms