Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ERCC6Q03468 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ERCC6Q03468 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms