Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TGFBR3Q03167 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms