Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT1Q02742 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms