Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DSC2Q02487 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms