Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNC1Q01954 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms